Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms