Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pramel3A2AHA7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pramel3A2AHA7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms