Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Calcoco2A2A6M5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calcoco2A2A6M5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms