Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Homer1Q9Z2Y3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms