Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CcniQ9Z2V9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms