Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd3Q9Z2D8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd3Q9Z2D8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms