Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn6Q9Z262 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn6Q9Z262 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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