Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NfkbiaQ9Z1E3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms