Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stxbp4Q9WV89 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms