Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Snx1Q9WV80 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snx1Q9WV80 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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