Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sema6cQ9WTM3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sema6cQ9WTM3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms