Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Psma1Q9R1P4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms