Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntn3Q9R1A3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntn3Q9R1A3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntn3Q9R1A3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntn3Q9R1A3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntn3Q9R1A3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ntn3Q9R1A3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Ntn3Q9R1A3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ntn3Q9R1A3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms