Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms