Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lamc3Q9R0B6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms