Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nek3Q9R0A5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms