Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AmfrQ9R049 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms