Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Col4a4Q9QZR9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col4a4Q9QZR9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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