Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnnt3Q9QZ47 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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