Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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VapbQ9QY76 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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VapbQ9QY76 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VapbQ9QY76 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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