Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms