Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnpy2Q9QXT0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnpy2Q9QXT0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms