Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Limd1Q9QXD8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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