Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms