Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rabgef1Q9JM13 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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