Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gde1Q9JL56 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms