Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Tuba8Q9JJZ2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tuba8Q9JJZ2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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