Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfra4Q9JJT2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfra4Q9JJT2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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