Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trappc4Q9ES56 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trappc4Q9ES56 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms