Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capn12Q9ER56 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms