Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r46Q9EQ45 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Vmn1r46Q9EQ45 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms