Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Syde1Q9DBZ9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Syde1Q9DBZ9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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