Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SrpraQ9DBG7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms