Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Chmp2aQ9DB34 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp2aQ9DB34 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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