Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9DAE8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms