Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph3bQ9DA80 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rsph3bQ9DA80 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms