Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc89Q9DA73 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc89Q9DA73 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms