Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pdzd9Q9D9M4 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms