Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx5Q9D8U8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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