Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam3aQ9D8T0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam3aQ9D8T0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms