Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi35Q9D8C4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms