Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vstm5Q9D806 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Vstm5Q9D806 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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