Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms