Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PrameQ9D4Z5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PrameQ9D4Z5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms