Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D4W2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms