Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubgcp4Q9D4F8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubgcp4Q9D4F8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms