Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syce1Q9D495 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce1Q9D495 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms