Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rufy3Q9D394 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy3Q9D394 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms