Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rnf128Q9D304 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf128Q9D304 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms