Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms